牛顿只在去世前不久才和几个朋友谈到受苹果启发的事，并且苹果只是落在他面前，没有砸中他。2010年，为庆祝英国皇家学会成立350周年，皇家学会把一部分科学著作原稿的电子版上传到网上。其中的一份牛顿好友威廉·斯蒂克利于1752年出版的回忆录就澄清了牛顿与苹果树的故事。南京大学、天津大学、汕头大学、英国剑桥三一学院、美国麻省理工学院、加拿大约克大学及日本东京大学都曾将牛顿老家的苹果树的后裔的枝条栽种到自家校园。

1983年，美国公共广播公司播出了一部名为《牛顿的苹果》的电视教育节目，共播出十余年。该节目90年代时曾引进中国。

流行文化

美国苹果公司最早的Logo就是一幅牛顿坐在苹果树下看书的钢笔绘画，由该公司创始人之一的罗纳德·韦恩所设计。虽然没有资料证明苹果公司的名称是否也来源于或部分地来源于牛顿的苹果，但苹果公司确实曾推出过一款名为牛顿的操作系统（见牛顿操作系统）及同名PDA（见Apple Newton）。

在2015年开播的日本特摄剧《假面骑士Ghost》中，牛顿为其中一个幽灵眼魂。

在2014年上线的日本RPG《大航海时代V》中，牛顿除保留科学家身份外，也成为一名可由玩家扮演的航海家。

牛顿和他的苹果经常成为科学题材电子游戏的宠儿。如在2009年由Petri Purho开发的游戏《蜡笔物理学》中，玩家需要在最后一关想办法让苹果砸醒打盹的牛顿。在2005年推出的中国游戏《帮助牛顿》(Help Newton)中，玩家需要通过各种办法让游戏中的苹果飞到牛顿手中。而在2016年推出的2D打架游戏《科学格斗》(Science Combat)中，玩家可以操纵牛顿用落地的苹果攻击对手，还可以用三棱镜射出的光线攻击对手。